საერთაშორისო ურთიერთობებისა და სტრატეგიული განვითარების დეპარტამენტი
სკოლამდელი და ზოგადი განათლების განვითარების დეპარტამენტი
ეკონომიკური დეპარტამენტი
პარალელურად ასრულებს საპარლამენტო მდივნის ფუნქციებს
ადმინისტრაცია (დეპარტამენტი)
სსიპ - საგანმანათლებლო კვლევების ეროვნული ცენტრი
პროფესიული განათლების განვითარების დეპარტამენტი
შიდა აუდიტის დეპარტამენტი
იურიდიული დეპარტამენტი
ა(ა)იპ პროფესიული უნარების სააგენტო
უმაღლესი განათლების განვითარების დეპარტამენტი
მეცნიერების განვითარების დეპარტამენტი
სამინისტროს სისტემაში შემავალი პროფესიული საგანმანათლებლო დაწესებულებები
ახალგაზრდობის საქმეთა დეპარტამენტი
სსიპ საქართველოს სოფლის მეურნეობის მეცნიერებათა აკადემია
სამინისტროს სისტემაში შემავალი უმაღლეს საგანმანათლებლო დაწესებულებები
სამინისტროს სისტემაში შემავალი სამეცნიერო - კვლევით დაწესებულებები
