სკოლამდელი და ზოგადი განათლების განვითარების დეპარტამენტი
ეკონომიკური დეპარტამენტი
პარალელურად ასრულებს საპარლამენტო მდივნის ფუნქციებს
საერთაშორისო ურთიერთობებისა და სტრატეგიული განვითარების დეპარტამენტი
შიდა აუდიტის დეპარტამენტი
იურიდიული დეპარტამენტი
ადმინისტრაცია (დეპარტამენტი)
პროფესიული განათლების განვითარების დეპარტამენტი
სსიპ - საგანმანათლებლო კვლევების ეროვნული ცენტრი
უმაღლესი განათლების განვითარების დეპარტამენტი
ა(ა)იპ პროფესიული უნარების სააგენტო
მეცნიერების განვითარების დეპარტამენტი
სსიპ საქართველოს სოფლის მეურნეობის მეცნიერებათა აკადემია
სამინისტროს სისტემაში შემავალი პროფესიული საგანმანათლებლო დაწესებულებები
სამინისტროს სისტემაში შემავალი უმაღლეს საგანმანათლებლო დაწესებულებები
სამინისტროს სისტემაში შემავალი სამეცნიერო - კვლევით დაწესებულებები
